Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ITGA4P13612 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms