Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PCNAP12004 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PCNAP12004 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PCNAP12004 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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