Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGB3P05106 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGB3P05106 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms