Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APODP05090 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APODP05090 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APODP05090 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APODP05090 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APODP05090 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
APODP05090 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
APODP05090 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
APODP05090 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms