Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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CLDN9O95484 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CLDN9O95484 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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