Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAPN9O14815 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAPN9O14815 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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