Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PHOX2AO14813 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PHOX2AO14813 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms