Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf172C9J069 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf172C9J069 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf172C9J069 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf172C9J069 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf172C9J069 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf172C9J069 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf172C9J069 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf172C9J069 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C9orf172C9J069 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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