Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C2CD4DB7Z1M9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms