Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GOLGA8JA6NMD2 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GOLGA8JA6NMD2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms