Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms