Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHKBQ9Y259 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms