Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS5Q9UPZ3 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms