Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC2LQ9UL33 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TRAPPC2LQ9UL33 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms