Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
FOXD3Q9UJU5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
FOXD3Q9UJU5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms