Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CGGBP1Q9UFW8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CGGBP1Q9UFW8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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