Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
XCL2Q9UBD3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms