Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RRBP1Q9P2E9 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRBP1Q9P2E9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms