Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCHIP1Q9P0W5 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms