Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ABCC13Q9NSE7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms