Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms