Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIM4Q9C037 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms