Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCGF6Q9BYE7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCGF6Q9BYE7 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms