Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FANCD2Q9BXW9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms