Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLVAPQ9BX97 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms