Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIRIP3Q9BW71 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms