Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
LITAFQ99732 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms