Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VAT1Q99536 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms