Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

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Length 831 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SORT1Q99523 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SORT1Q99523 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SORT1Q99523 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SORT1Q99523 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SORT1Q99523 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SORT1Q99523 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SORT1Q99523 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SORT1Q99523 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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