Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PCNX1Q96RV3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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