Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
UBE2E2Q96LR5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
UBE2E2Q96LR5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms