Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGAP3Q96FM1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms