Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms