Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBXN4Q92575 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms