Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCG3Q8WXD2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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