Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

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Length 1,954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHD5Q8TDI0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CHD5Q8TDI0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD5Q8TDI0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD5Q8TDI0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CHD5Q8TDI0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CHD5Q8TDI0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CHD5Q8TDI0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CHD5Q8TDI0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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