Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHX4

SPATA3, Spermatogenesis-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA3Q8NHX4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SPATA3Q8NHX4 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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