Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM35BQ8NCS4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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