Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPC24Q8NBT2 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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