Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LRRC28Q86X40 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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LRRC28Q86X40 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LRRC28Q86X40 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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