Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms