Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms