Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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USP43Q70EL4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
USP43Q70EL4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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