Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 NQO2-205ENST00000380455 10084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CCBE1-202ENST00000439986 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC026797.1-201ENST00000624837 2869 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HRCT1Q6UXD1 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms