Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ANKRD54Q6NXT1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ANKRD54Q6NXT1 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms