Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATL3Q6DD88 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms