Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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C9orf135Q5VTT2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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