Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LACTB2Q53H82 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms