Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DUSP6Q16828 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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