Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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RTN1Q16799 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RTN1Q16799 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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